Die AG Klinische Mikrobiomforschung konnte an der Uniklinik Köln das klinisch-wissenschaftliche Programm für fäkale Mikrobiotatransfers (FMT, Stuhltransplantation) in die Infrastruktur Kölner Mikrobiotabank / Cologne Microbiota Bank (CMB) umsetzen, die deutschlandweit Standards setzt hinsichtlich Qualität, Effektivität und Sicherheit. Bereits früh wurde die Nutzung verkapselter FMT- Präparate für die Therapie der rekurrenten Clostridioides difficile Infektion (rCDI) etabliert. Dieses Therapieangebot ist inzwischen für diese Indikation in Leitlinien verankert.

2020 wurde das GMP-Labor (GMP = Good Manufacturing Practice, Gute Herstellungspraxis) für die Herstellung von Präparaten für FMT eröffnet, in dem wir inzwischen Prüfpräparate für zahlreiche klinische Prüfungen mit verschiedenen Indikationen über die rCDI hinaus zur Verfügung stellen. Die Herstellung von Präparaten für den FMT erfolgt unter GMP-Bedingungen nur aus Stuhlspenden, die unter Einhaltung strenger Hygienerichtlinien verarbeitet werden und immer strikt auf potentielle Krankheitserreger geprüft sind. Zur Gewährleistung eines stets ausreichenden Kontingents an FMT-Präparaten, sind wir regelmäßig auf der Suche nach passenden Stuhlspenderinnen und Stuhlspendern.

Unsere Einrichtung ist Teil des europäischen Netzwerkes EurFMT und ist maßgeblich an der Harmonisierung von Herstellungs- und Behandlungsprozessen auf nationaler und europäischer Ebene beteiligt.

Die Arbeitsgruppe untersucht präventive und therapeutische Ansätze im Umgang mit Kolonisierungen und Infektionen durch multiresistente bakterielle Erreger. Im Mittelpunkt dieser Forschung stehen Projekte, die im Rahmen der Thematischen Translationalen Unit (TTU) Healthcare-Associated Infections (HAI) des Deutschen Zentrums für Infektionsforschung (DZIF) durchgeführt werden. Die TTU HAI hat es sich zum Ziel gesetzt, Alternativen oder Ergänzungen zur konventionellen Antibiotika-Monotherapie voranzutreiben, welche keinen oder nur begrenzten Selektionsdruck auf die Mikrobiota ausüben. In der klinischen Studie RESET-MDR erhalten wir die Möglichkeit im Verbund mit DZIF Forschungsgruppen in Braunschweig, München und Aachen die Wirkmechanismen des FMT weiter aufzuschlüsseln. Langfristig sollen sogenannte „Live Biotherapeutic Products (LBPs)“ entwickelt werden, die dann gezielt aus Stuhl identifizierte und isolierte mikrobielle Konsortien enthalten. Die Forschung der Arbeitsgruppe in diesem Bereich geht also über eine rein deskriptive Analyse hinaus und fokussiert sich im Sinne der Translation auf patientenorientierte, innovative Produktentwicklung.

Priv.-Doz. Dr. Lena Biehl, Stellvertretende Leitung der CMB
Prof. Dr. Klaus Schomäcker, Sachkundige Person
Dr. Julia Heger, Leitung der Qualitätssicherung
Dr. Anastasia Tsakmaklis, Projektmanagement, Leitung der Herstellung
Nina Fischer, Apothekerin, Leitung der Qualitätskontrolle, Stellvertretende Sachkundige Person
Azade Pütz, Apothekerin, Stellvertretende Sachkundige Person
Dr. Doris Heidmann, TTU HAI Managerin, Stellvertretende Leitung der Qualitätssicherung
Dr. Fedja Farowski, Postdoc, Stellvertretende Leitung der Herstellung
Dr. Sarina Butzer, Prüfärztin
Dr. Marta Rebeca Cruz Aguilar, Prüfärztin
Lucas Fein, Bioinformatiker
Lars Dierkes, MTA
Birgitta Domscheit, MTA
Christine Schlemmer, Projektassistenz
Alexander Schumski, SHK
Dilara Bicerikli, SHK
Maike Stiel, SHK
Henryk Gottschalk, SHK
Jonas Eigler, medizinischer Doktorand

In Kooperation mit dem Klinischen Studienzentrum II für Infektiologie:

Tatjana Lammertz, Studienassistentin
Melanie Reiner, medizinische Doktorandin, Studienassistentin
Daniela Schönherr, Studienassistentin
Melanie Lisnieska, Studienassistentin
Alina Thiel, Studienassistentin
Katja Schaprian, Studienassistentin